Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms