Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFE3P19532 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TFE3P19532 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms