Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LIG1P18858 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LIG1P18858 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LIG1P18858 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LIG1P18858 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms