Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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PTPRAP18433 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRAP18433 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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