Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPI1P17947 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPI1P17947 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPI1P17947 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms