Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DESP17661 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DESP17661 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DESP17661 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DESP17661 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DESP17661 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
DESP17661 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DESP17661 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DESP17661 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms