Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD1P17405 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms