Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA1P17302 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms