Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB1P16220 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms