Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRF1P14222 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms