Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNB1P11230 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms