Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms