Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1AO95602 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1AO95602 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms