Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP2O75323 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms