Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPAG9O60271 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPAG9O60271 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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