Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSH5O43196 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms