Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGSM2O43147 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms