Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNMO15061 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNMO15061 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNMO15061 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNMO15061 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms