Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TXNDC9O14530 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TXNDC9O14530 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms