Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBAG9O00559 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms