Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms