Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF316A6NFI3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms