Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PEX16Q9Y5Y5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX16Q9Y5Y5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX16Q9Y5Y5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms