Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF6Q9Y4K3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF6Q9Y4K3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms