Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SF3B6Q9Y3B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms