Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HHLA3Q9XRX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HHLA3Q9XRX5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms