Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO1Q9UM00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMCO1Q9UM00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO1Q9UM00 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO1Q9UM00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms