Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDRG4Q9ULP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDRG4Q9ULP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDRG4Q9ULP0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms