Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf18Q9UK00 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf18Q9UK00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms