Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRM2Q9UI43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MRM2Q9UI43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRM2Q9UI43 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms