Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMTOR3Q9UHA4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms