Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MBD5Q9P267 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
MBD5Q9P267 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
MBD5Q9P267 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
MBD5Q9P267 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MBD5Q9P267 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms