Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIC8BQ9NVN3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIC8BQ9NVN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIC8BQ9NVN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIC8BQ9NVN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms