Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTBP3Q9NS15 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LTBP3Q9NS15 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LTBP3Q9NS15 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LTBP3Q9NS15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
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