Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF3Q9NR23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF3Q9NR23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF3Q9NR23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms