Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD34

LYRM4, LYR motif-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM4Q9HD34 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYRM4Q9HD34 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LYRM4Q9HD34 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM4Q9HD34 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms