Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARVBQ9HBI1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PARVBQ9HBI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVBQ9HBI1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVBQ9HBI1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms