Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GANQ9H2C0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GANQ9H2C0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GANQ9H2C0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms