Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NLRP1Q9C000 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NLRP1Q9C000 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NLRP1Q9C000 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NLRP1Q9C000 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms