Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D1Q9BX74 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TM2D1Q9BX74 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM2D1Q9BX74 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms