Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B5Q9BWJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B5Q9BWJ5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B5Q9BWJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms