Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRFN3Q9BTN0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRFN3Q9BTN0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRFN3Q9BTN0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRFN3Q9BTN0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms