Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYT11Q9BT88 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYT11Q9BT88 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYT11Q9BT88 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms