Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAL3ST1Q99999 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAL3ST1Q99999 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GAL3ST1Q99999 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms