Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPAS2Q99743 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPAS2Q99743 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms