Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAT1Q99536 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAT1Q99536 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAT1Q99536 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAT1Q99536 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms