Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WRNIP1Q96S55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
WRNIP1Q96S55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
WRNIP1Q96S55 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms