Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITCHQ96J02 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITCHQ96J02 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITCHQ96J02 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms