Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM44Q96DX7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM44Q96DX7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM44Q96DX7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms