Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCN3Q96D15 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN3Q96D15 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms